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biokatalyse2021

 

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Projekte

Die Abteilung für Mikrobiologie an der Universität Hamburg beschäftigt sich mit sechs zentralen Themenschwerpunkten.

Die Gruppe sucht mit Hilfe von Metagenomanalysen gezielt nach neuartigen Biokatalysatoren oder Biomolekülen mit ungewöhnlichen Eigenschaften. Dazu nutzen wir das große genetische Potential der nicht kultivierten Mikroorganismen aus. Im Zuge dieser Arbeiten sind wir insbesondere an Lipasen, Cellulasen und Decarboxylasen interessiert.

AG Streit

Im Rahmen unserer Metagenomarbeiten suchen wir darüber hinaus nach neuen Wirkstoffen, die mikrobielle Biofilme im Wachstum inhibieren. Biofilme sind bakterielle Aufwüchse auf Oberflächen, die oft pathogen sind oder zumindest störend. Biofilme zeichnen sich im hohen Masse durch Biozid- bzw. Antibiotkaresistenzen aus. Daher entwickeln wir mit unseren Metagenomansätzen neue Strategien zur Bekämpfung von Biofilmen.

AG Streit

Zusammen mit dem Göttinger Genomlabor (G2L) sequenzieren wir zudem Genome von Gram-negativen Modellorganismen, die eine Interaktion mit Pflanzen eingehen können. Dabei handelt es sich z.B. um Burkholderia glumae PG1 und Sinorhizobium fredii USDA257. Vor kurzem wurde zudem von uns das 6,9 Mbp große Genom von Rhizobium sp. NGR 234 fertig gestellt und publiziert.

AG Streit

Zudem sind wir an der Charakterisierung von Nitrit-oxidierenden Mikroorganismen interessiert. Schwerpunkt dieser Arbeiten ist die Charakterisierung neuer Mikroorganismen (z.B. Nitrospira sp.) sowie ein besseres Verständnis ihrer ökologischen Rolle in der Natur.

AG Spieck

Ein weiterer Fokus der Arbeiten liegt im Bereich der Ammoniak-oxidierenden Mikroorganismen. Dabei analysieren wir die Physiologie, und Phylogenie dieser Organismen.

AG Pommerening-Röser

Mikrobielle Diversität, Aktivität und Stoffwechselstrategien in hydrothermalen Tiefseeschloten sind ein weiteres Gebiet. Hier mit besonderem Interesse für [NiFe]Hydrogenasen und anderer Enzyme für den Energiehaushalt dort angesiedelter Epsilonproteobacteria.

AG Perner

Bild3
Biofilm2
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